Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms