Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8C1

Rtp1, Receptor-transporting protein 1, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp1Q8C8C1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rtp1Q8C8C1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rtp1Q8C8C1 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rtp1Q8C8C1 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rtp1Q8C8C1 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rtp1Q8C8C1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtp1Q8C8C1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtp1Q8C8C1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtp1Q8C8C1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtp1Q8C8C1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp1Q8C8C1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp1Q8C8C1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp1Q8C8C1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp1Q8C8C1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp1Q8C8C1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp1Q8C8C1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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