Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfrp1Q8C4U3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfrp1Q8C4U3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfrp1Q8C4U3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfrp1Q8C4U3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sfrp1Q8C4U3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sfrp1Q8C4U3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfrp1Q8C4U3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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