Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Nop53Q8BK35 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Nop53Q8BK35 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Nop53Q8BK35 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Nop53Q8BK35 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Nop53Q8BK35 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Nop53Q8BK35 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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