Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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Htatsf1Q8BGC0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Htatsf1Q8BGC0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Htatsf1Q8BGC0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Htatsf1Q8BGC0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Htatsf1Q8BGC0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Htatsf1Q8BGC0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Htatsf1Q8BGC0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Htatsf1Q8BGC0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Htatsf1Q8BGC0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Htatsf1Q8BGC0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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