Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms