Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms