Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Usp49Q6P9L4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Usp49Q6P9L4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Usp49Q6P9L4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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