Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slx4Q6P1D7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slx4Q6P1D7 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slx4Q6P1D7 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Slx4Q6P1D7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slx4Q6P1D7 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slx4Q6P1D7 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Slx4Q6P1D7 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slx4Q6P1D7 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms