Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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