Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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