Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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