Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms