Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Cnot7Q60809 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Cnot7Q60809 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Cnot7Q60809 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Cnot7Q60809 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Cnot7Q60809 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Cnot7Q60809 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Cnot7Q60809 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Cnot7Q60809 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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