Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM9

C1ql4, Complement C1q-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1ql4Q4ZJM9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C1ql4Q4ZJM9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms