Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trp53i11Q4QQM4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trp53i11Q4QQM4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trp53i11Q4QQM4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trp53i11Q4QQM4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trp53i11Q4QQM4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trp53i11Q4QQM4 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trp53i11Q4QQM4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trp53i11Q4QQM4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trp53i11Q4QQM4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Trp53i11Q4QQM4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trp53i11Q4QQM4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trp53i11Q4QQM4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Trp53i11Q4QQM4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Trp53i11Q4QQM4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Trp53i11Q4QQM4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Trp53i11Q4QQM4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trp53i11Q4QQM4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Trp53i11Q4QQM4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trp53i11Q4QQM4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trp53i11Q4QQM4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Trp53i11Q4QQM4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trp53i11Q4QQM4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trp53i11Q4QQM4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trp53i11Q4QQM4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trp53i11Q4QQM4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trp53i11Q4QQM4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trp53i11Q4QQM4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trp53i11Q4QQM4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trp53i11Q4QQM4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trp53i11Q4QQM4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trp53i11Q4QQM4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trp53i11Q4QQM4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trp53i11Q4QQM4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trp53i11Q4QQM4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trp53i11Q4QQM4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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