Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrxosQ3UL53 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrxosQ3UL53 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrxosQ3UL53 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrxosQ3UL53 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrxosQ3UL53 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrxosQ3UL53 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrxosQ3UL53 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrxosQ3UL53 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrxosQ3UL53 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CrxosQ3UL53 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrxosQ3UL53 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrxosQ3UL53 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrxosQ3UL53 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CrxosQ3UL53 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrxosQ3UL53 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrxosQ3UL53 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrxosQ3UL53 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrxosQ3UL53 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrxosQ3UL53 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrxosQ3UL53 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrxosQ3UL53 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrxosQ3UL53 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrxosQ3UL53 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrxosQ3UL53 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrxosQ3UL53 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrxosQ3UL53 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrxosQ3UL53 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrxosQ3UL53 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CrxosQ3UL53 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxosQ3UL53 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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