Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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