Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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