Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

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Length 876 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ap5b1Q3TAP4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ap5b1Q3TAP4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ap5b1Q3TAP4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ap5b1Q3TAP4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ap5b1Q3TAP4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ap5b1Q3TAP4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ap5b1Q3TAP4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms