Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Shroom4Q1W617 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
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Shroom4Q1W617 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Shroom4Q1W617 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Shroom4Q1W617 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Shroom4Q1W617 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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