Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rpusd3Q14AI6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rpusd3Q14AI6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rpusd3Q14AI6 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rpusd3Q14AI6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rpusd3Q14AI6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rpusd3Q14AI6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rpusd3Q14AI6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rpusd3Q14AI6 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rpusd3Q14AI6 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Rpusd3Q14AI6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Rpusd3Q14AI6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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