Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms