Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf541Q0GGX2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms