Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms