Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff2Q03404 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms