Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snai1Q02085 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snai1Q02085 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms