Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
RykQ01887 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RykQ01887 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
RykQ01887 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RykQ01887 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RykQ01887 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RykQ01887 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RykQ01887 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms