Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms