Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9xP70398 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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