Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CgnP59242 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CgnP59242 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CgnP59242 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CgnP59242 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CgnP59242 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CgnP59242 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CgnP59242 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CgnP59242 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CgnP59242 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CgnP59242 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CgnP59242 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CgnP59242 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CgnP59242 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CgnP59242 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CgnP59242 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CgnP59242 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CgnP59242 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CgnP59242 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CgnP59242 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CgnP59242 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CgnP59242 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CgnP59242 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CgnP59242 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CgnP59242 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CgnP59242 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CgnP59242 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CgnP59242 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CgnP59242 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CgnP59242 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CgnP59242 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms