Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace1P56818 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace1P56818 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace1P56818 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace1P56818 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace1P56818 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bace1P56818 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bace1P56818 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bace1P56818 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bace1P56818 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms