Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP153P49790 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP153P49790 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP153P49790 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP153P49790 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP153P49790 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP153P49790 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP153P49790 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP153P49790 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP153P49790 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP153P49790 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP153P49790 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP153P49790 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP153P49790 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP153P49790 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP153P49790 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP153P49790 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP153P49790 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP153P49790 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP153P49790 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP153P49790 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP153P49790 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP153P49790 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP153P49790 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP153P49790 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP153P49790 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP153P49790 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP153P49790 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP153P49790 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP153P49790 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP153P49790 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP153P49790 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP153P49790 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP153P49790 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP153P49790 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP153P49790 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP153P49790 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP153P49790 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP153P49790 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP153P49790 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP153P49790 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP153P49790 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP153P49790 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP153P49790 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP153P49790 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP153P49790 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP153P49790 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP153P49790 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP153P49790 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP153P49790 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP153P49790 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP153P49790 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP153P49790 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP153P49790 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP153P49790 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP153P49790 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP153P49790 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP153P49790 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP153P49790 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP153P49790 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP153P49790 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP153P49790 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP153P49790 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP153P49790 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP153P49790 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP153P49790 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP153P49790 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP153P49790 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP153P49790 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP153P49790 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP153P49790 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP153P49790 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP153P49790 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP153P49790 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP153P49790 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP153P49790 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP153P49790 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP153P49790 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP153P49790 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP153P49790 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP153P49790 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP153P49790 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP153P49790 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP153P49790 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP153P49790 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP153P49790 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP153P49790 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP153P49790 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP153P49790 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP153P49790 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP153P49790 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP153P49790 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP153P49790 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP153P49790 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP153P49790 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP153P49790 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP153P49790 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP153P49790 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP153P49790 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP153P49790 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms