Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SrprbP47758 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrprbP47758 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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SrprbP47758 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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SrprbP47758 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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SrprbP47758 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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SrprbP47758 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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SrprbP47758 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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SrprbP47758 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrprbP47758 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SrprbP47758 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrprbP47758 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms