Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aco1P28271 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aco1P28271 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aco1P28271 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aco1P28271 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aco1P28271 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aco1P28271 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms