Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PparaP23204 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PparaP23204 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PparaP23204 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PparaP23204 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PparaP23204 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PparaP23204 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PparaP23204 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PparaP23204 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PparaP23204 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PparaP23204 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PparaP23204 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PparaP23204 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PparaP23204 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PparaP23204 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PparaP23204 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PparaP23204 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PparaP23204 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PparaP23204 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PparaP23204 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PparaP23204 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PparaP23204 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PparaP23204 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PparaP23204 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PparaP23204 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PparaP23204 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PparaP23204 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PparaP23204 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PparaP23204 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PparaP23204 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PparaP23204 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PparaP23204 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PparaP23204 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PparaP23204 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PparaP23204 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PparaP23204 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PparaP23204 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PparaP23204 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PparaP23204 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PparaP23204 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PparaP23204 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PparaP23204 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms