Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms