Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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P18530 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18530 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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P18530 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18530 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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P18530 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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P18530 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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P18530 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
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P18530 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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