Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl9P18340 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms