Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf1P09925 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf1P09925 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf1P09925 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms