Protein–RNA interactions for Protein: P04944

Ig kappa chain V-VI region NQ5-78.2.6, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04944 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04944 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04944 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.71
P04944 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P04944 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P04944 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P04944 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P04944 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P04944 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P04944 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P04944 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms