Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited2O35740 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms