Protein–RNA interactions for Protein: O35405

Pld3, Phospholipase D3, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld3O35405 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pld3O35405 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pld3O35405 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms