Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3542K7N6U2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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