Protein–RNA interactions for Protein: K7N693

Gm3043, Predicted gene 10408, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3043K7N693 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3043K7N693 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3043K7N693 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3043K7N693 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3043K7N693 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3043K7N693 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3043K7N693 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3043K7N693 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3043K7N693 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3043K7N693 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms