Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms