Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms