Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms