Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms