Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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